Zajišťuje výuku základní morfologické medicínské disciplíny prakticky ve všech typech lékařských i nelékařských oborů v pregraduálním studiu a specializovanou výuku v postgraduálním studiu, zaměřenou na vědeckou výchovu a aplikující dosažené vědecké výsledky členů ústavu.
V oblasti vědeckého výzkumu byl a je ústav zaměřen na výzkum morfologických zákonitostí úpravy lymfatické a imunokompetentní tkáně. Vycházejíc z tradic, kdy byl popisován rozsah a zvláštní uspořádání tohoto systému v oblasti horních dýchacích cest, dutiny ústní a hltanu se nyní snaží skupina pracovníků odhalit zákonitosti uspořádání v břišním oddílu trávicí trubice.